Pero finalmente los patriotas vencieron a los realistas en la segunda Cuchilla de Taindalá el 22 de diciembre y en el Guáitara el 23 de diciembre. Las tropas patriotas al inicio fueron derrotadas en la primera batalla Cuchilla de Taindala en el Río Guáitara y se tuvieron que retirar a Túquerres, mientras los realistas se apoderaron de sus armas y vestimenta, así como consiguieron el apoyo de la región, que les donó reses, armas, dinero y jóvenes reclutas, teniendo el control durante los siguientes 3 meses. La caballería entonces ingreso, con total frialdad, para despojar de sus ornamentos, y otros tantos bienes de valor, a los sagrados y venerables iconos de las vírgenes y los santos. "Tenemos derecho a tratar al pueblo de Pasto como prisionero de guerra, porque todo él, sin excepción de persona, nos hace la guerra, y para confiscarles todos sus bienes como pertenecientes a enemigos; tenemos derecho, en fin, a tratar esa guarnición con el último rigor de la guerra, y al pueblo, para confinarlo en prisiones estrechas como prisionero de guerra en las plazas fuertes marítimas. Ni siquiera los templos de Santiago, San Juan, San Andrés, Taminanguito y San Sebastián, llegaron a servir de protección para sus refugiados que esperaban que las tropas tengan algo de consideración por los recintos sagrados, los cuales se volvieron escenarios de crímenes horrorosos lleno de anticlericalismo.
Sus orígenes se encuentran en el Seminario de Quebec, fundado por el primer obispo de Nueva Francia, San Francisco de Laval, en 1663. La facultad de Arquitectura se encuentra en la ciudad vieja, en el edificio del antiguo seminario. Francisco Narciso de Laprida, diputado presidente. Por ende, se presentó una rebelión el 22 de octubre de 1822 por parte de restantes de tropas realistas, a cargo del general don Benito Remigio Boves y el caudillo Agustín Agualongo (sumándose otras figuras como Estanislao Merchancano, Francisco Ibarra y José Folleco) con apoyo de guerrillas fieles al rey e instituciones coloniales como el Protector de indios (a cargo de Ramón Medina), curas 10. Conclusión: Justificación del Uso de Clarinex en la Práctica Clínica (http://Farmacia41.es) pueblo como Manuel José Troyano, o Cacicazgos como el de Andrés Pianda (gobernador de Anganoy) y otros Señoríos indígenas de Ecuador con su red de jefaturas étnicas (aunque no pudiendo reactivar su alianza con los negros del Patía). Las tropas realistas, lideradas por el coronel Basilio Modesto García, derrotaron al ejército dirigido por Simón Bolívar, a pesar de su inferioridad numérica y tecnológica. Así, Bolívar, aunque en sintonía con la mentalidad patrimonialista de las elites coloniales (debido a su psicología de Mantuano) al lograr convencerlas con facilidad su rendición si daba garantías de protección a sus Fueros y Patrimonios económicos, caería en el error de suponer que, por la pre-eminencia social de sus aparentes nuevos aliados en la elite lugareña que había logrado avasallar, sería razón suficiente para lograr la adhesión de los sectores populares (comunidades indias y campesinas) al proyecto republicano y de estado-nación criollo, demostrándose entonces que no bastaba con seducir a los dirigentes de Pasto para lograr la rendición de los pastusos como población.
Por otro lado los indígenas veneraban al rey y a los dirigentes pastusos no les convenía un cambio que perjudicara sus intereses". Nuestra división está aquí, y no hace una hora que me ha pedido de Colombia, por temor de los pastusos. No obstante, la derrota sufrida por Simón Bolívar quedó grabada en su consciencia como una grave humillación a su ego, siendo indigno para él y su ambición de gloria el que lo vencieran unos milicianos indígenas con menor preparación e inferioridad numérica, al grado que los patriotas a su mando intentaron modificar el relato de la batalla, que quedó en tablas, para dejar como ganador indiscutible a Bolívar en lo que fue una Victoria pírrica. Si bien hubo algunos intentos de las elites locales por condenar la sublevación realista, como las excomuniones del vicario de Pasto, Aurelio Rosero, al final no se pudo apaciguar el celo realista en la población local (agrediéndose a la casa del obispo), lo que sería una demostración que el alzamiento no fue producto de algún fanatismo religioso ni algún tipo manipulación clerical, ni de las clases altas, sobre la población pastusa. Ni las monjas en los conventos estaban a salvo de aquella orgía libidinosa.
También destruyeron archivos públicos, libros parroquiales, entre otras propiedades; además, asesinaron a más de 400 civiles hombres, mujeres, ancianos y niños, una cuarta parte de la población, en una orgía llena de muerte, destrucción y pillaje. Las tropas belicosas de las provincias confederadas de la Nueva Granada reducirán a pavesas a Pasto y sólo podrá evitar su irremediable destrucción poniendo inmediatamente en libertad las personas del Presidente, oficiales y soldados, pérfidamente sorprendidos, y entregando todas las armas. Posteriormente, Boves estableció una "contribución para el ejército real" el cual debía ser pagada por las clases altas de Pasto que hayan sido ricos felones "traidoras a la causa", mientras suspendió el cobro del Tributo indígena, obteniendo el apoyo del campesinado indígena y beneficios políticos. Soldados. Una nueva bandera del ejército os presento, para que reconociéndola sepáis que ella ha de ser vuestra guía y punto de reunión. Ella será víctima del furor de un Reino entero, puesto en la actitud de vengarse y aniquilarla. Casi una década después, tras el colapso del Virreinato de Nueva Granada y el ingreso de tropas venezolanas en apoyo a los republicanos de Bogotá, se produjo la Batalla de Bomboná (o Batalla de Cariaco) el 7 de abril de 1822, a 50 km de Pasto.
